环氧乙烷能有效杀灭各种微生物，其杀菌机理主要是EO能与蛋白质上羧基（-COOH）、氨基（-NH3）、羟基（-OH）等发生反应，使蛋白质失去活性而致使微生物死亡。灭菌时，温度和湿度要求很重要，当温度低于35℃或相对湿度低于25%时，达不到灭菌效果，即使延长灭菌时间也无效。灭菌周期与灭菌作用时间灭菌周期：灭菌全过程。包括预处理、抽真空、加EO、EO作用过程、换气等一系列步骤的时间。灭菌作用时间：加EO结束至换气前的时间。环氧乙烷化学性质活泼，与催化剂接触可引起化学反应，这种反应随温度、压力和水量的增加而加快，产生黄色的粘稠物质，容易堵塞管道，影响灭菌效果。化学性质较为稳定的气体混合使用（如：CO2、N2），能降低成本、增加安全性。

灭菌柜各有一个单独的入口门和出口门，沿水平方向打开。配有门封密闭及检漏系统，确保柜室的密封性能。如果检测发现漏气现象，电脑控制系统将在加入环氧乙烷之前自动中止此阶段。灭菌柜配有EO加药入口，可控制进入EO气体的温度，可按工艺要求进行加药和清洗。配有真空系统、加湿系统、加热系统、内循环风机系统及排风系统。配有先进的控制系统和管理系统，实现所有参数的自动采集和控制。解析：采用通风和加热系统将产品上吸附的EO气体析出。灭菌阶段完成后，将处理过的产品移入解析室.解析室配有加热系统、循环风系统和排风系统，温度、排风间隙和时间可自动控制，按灭菌工艺验证确认的时间运行，将产品中吸附的EO气体析出，使产品残留EO含量符合要求。

预真空：应排除灭菌室和负载中的空气，预真空度的大小决定残留空气的多少，而残留空气可直接影响环氧乙烷气体、热量、湿气到达被灭菌物品的内部，所以加湿前的真空度对灭菌效果影响是非常大的。保压：真空度维持稳定、无泄漏。加湿：灭菌物品的含水量、微生物本身的干燥程度和灭菌环境的相对湿度，对环氧乙烷的灭菌作用均有显著的影响。EO环氧乙烷解析在抽真空后、加药前，此时灭菌器内的湿度应控制30%RH～80%RH范围内。在环氧乙烷灭菌工艺中，湿度是主要的参数。南京环氧乙烷解析原理在实际灭菌时，被灭菌物品常常用纸或塑料薄膜、纸盒等包装，灭菌过程中一部分水分和环氧乙烷被包装物吸收，因此必须根据灭菌物品及包装物的湿度和吸收情况来选择合适的相对湿度，通常选择60%±10%的相对湿度。

迄今为止，所有资料显示环氧乙烷EO灭菌作用是不可逆的，也就是说环氧乙烷EO是杀菌剂(sterileagent)而不是消毒剂(disinfectant)。根据各种临床、科研结果显示环氧乙烷EO是所有化学消毒剂或灭菌剂中灭菌效果好的一种。应用范围：环氧乙烷不能用于食品的消毒，环氧乙烷水解后，可产生少量有毒的乙二醇，也不能用于血液灭菌，冈为它可导致细胞溶解，补体灭活和凝血酶破坏。环氧乙烷不损害灭菌的物品且穿透性很强，多数不宜用一般方法灭菌的物品均可用环氧乙烷消毒和灭菌。可用于金属制品、内镜、透析器和一次性使用的医疗器械的灭菌，各种织物、塑料制品等工业消毒灭菌，传染病疫源地物品(如化纤织物、皮革、纸张、文件、油画)消毒处理。